稽山中学遗迹,也许是东晋时孙恩反晋的军营,那十八口古井,是孙恩屯兵之时饮水之需所挖掘。根据《资治通鉴》记载:"孙恩因民心骚动,自海岛帅其党杀上虞令,遂攻会稽。会稽内史王凝之,羲之之子也,世奉天师道,不出兵,亦不设备,日于道室稽颡跪咒。官属请出兵讨恩,凝之曰:“我已请大道,借鬼兵守诸津要,各数万,贼不足忧也。”及恩渐近,乃听出兵,恩已至郡寅,恩陷会稽,凝之出走,恩执而杀之,并其诸子。凝之妻谢道蕴,弈之下。甲女也,闻寇至,举措自若,命婢肩舆,抽刀出门,手杀数人,乃被执"。
孙恩,出身琅琊孙氏,其家族在东晋属于“寓居江左的次等士族”。文史家陈寅恪指出:“孙恩世居南方,与其他南来下层北人一样,由于朝代更替,已变成南方的低下阶级”。 孙恩的叔父孙泰师从钱塘(今浙江省杭州市)人杜子恭,学习秘术。杜子恭死后,孙泰继任五斗米道教主,教徒广布南方,会稽内史谢輶揭发孙泰造反的阴谋,孙泰遭司马道子诛杀。孙恩此时逃入海岛(或为今舟山群岛)。孙泰余众当时认为孙泰是“蝉蜕登仙”,到海岛中支持孙恩,孙恩于是聚集了百多人,伺机复仇。
隆安三年(399年),东晋执政者司马元显(司马道子之子)征调因三吴门阀免除官奴身份成为佃客的民众,此举激起当地门阀的愤怒不满;孙恩乘着人心不稳,率众乘机进攻上虞并杀上虞县令,随后攻克会稽,会稽内史王凝之被杀,孙恩部众增至数万人。当时会稽郡、吴郡、、义兴郡、临海郡、永嘉郡、东阳郡及新安郡皆有人响应孙恩叛变,三吴八郡于是一时皆叛,孙恩部众亦增至数十万人。 当时郡县官员大多不是被杀就是弃郡逃亡,孙恩于是据守会稽,自号征东将军,为其党众改了个称号为“长生人”,并宣令诛杀异己,连婴孩也不放过,于是大量人死亡。朝廷内外戒严,遣徐州刺史谢琰与镇北将军刘牢之前往镇压,孙恩败而亡。